Фразеологизм звучит так: пройти сквозь огонь и воду (и медные трубы).
Буквально: пройти через все испытания, получить большой опыт.
Слова вода и водка исторически родственны, но сейчас их вряд ли можно признать однокоренными, значение слова водка невозможно истолковать через значение слова вода. Приведем статью из этимологического словаря Н. М. Шанского и Т. А. Бобровой.
Во́дка. Искон. Суф. производное от вода. Первоначальное значение «спиртовой лекарственный настой» (на травах). Значение «водка», очевидно, возникло у этого слова под влиянием польск. wódka — свободной кальки лат. aqua vita «алкоголь» (буквально — «вода жизни»).
Если имеется в виду вода, которой дали отстояться, верно: отстоянная вода.
Предпочтительно: Они прошли огонь, и воду, и медные трубы. Отсутствие запятых может указывать на то, что первые два однородных члена предложения образуют интонационно-логическое единство.
Корректно: Почему я часто упоминаю о четырёх элементах: земле, воде, воздухе и огне?
Возможны оба варианта, но более употребительно минерализованная вода.
Перед союзом и нужна запятая, потому что он соединяет две грамматические основы — огонь погас и тени исчезли.
Кавычки не нужны.
Налить (немного) воды, налить (эту) воду, выпить (стакан) воды, выпить (всю) воду.
