Эти слова могут быть синонимами, но не в любом контексте. Подробнее см. в словарях.
Такие сочетания возможны.
Мыслить в сослагательном наклонении здесь - представлять себе события, которые могли бы произойти, но не произошли.
В этом случае запятая перед союзом как не нужна: оборот имеет значение образа действия (=«по-шерлок-холмсовски»).
Правильно: Мы ни на что не намекаем...
Не вполне ясно, как можно мыслить фактами, если под фактом, как известно, понимается событие, происшествие, случай и т. п. Может быть, речевой оборот оперировать фактами способен выразить авторскую мысль?
Плоды были не на деревьях, не между ними и не на дороге.
Верно раздельное написание частицы НЕ с причастием, имеющим зависимые слова.
Запятая не нужна. Ни тот ни другой – устойчивый оборот с повторяющимся союзом, внутри таких конструкций запятая не ставится. Ср.: и день и ночь; и смех и горе; и стар и млад; и так и этак; и там и сям; и туда и сюда.