Если Вы спрашиваете о смысловых различиях, то их нет.
Лицензия - это и есть "право". Поэтому верно: годовая лицензия на использование.
Лучше: право на использование.
Да, если Вы готовы соотнести это слово с каким-либо понятием.
Предпочтителен первый вариант. Обособлять выражение по своему усмотрению не нужно.