Правильно Самолёт выполнял перелёт с завода на аэродром.
Предлог из антонимичен предлогу в, а предлог с — предлогу на.
Да, это будет считаться лексической ошибкой.
Верно: Махонёка.
Оба варианта верны: в первом указано название аэропорта, а во втором – расположение.