Казань – существительное женского рода: в Казани.
Лучше: агентство Казани.
См. в «Письмовнике».
Корректно: города Казани, о городе Чистополе.
Правильно: в городе Казани. См. в «Письмовнике».
Гласная А в этом слове - непроверяемая. Обращайтесь к словарю.