В нормативных орфоэпических словарях русского языка это слово не зафиксировано, а в академическом орфографическом словаре, размещенном на ресурсе «Академос» Института русского языка им. В. В. Виноградова РАН, и в Орфографическом словаре русского языка как государственного языка Российской Федерации варианты дисгра́фия и дисграфи́я даны как равноправные.
Правописание приставки диз-/дис- не подчиняется общему правилу о написании приставок на -з, -с. Эта приставка пишется с буквой с перед несонорными согласными, выбор буквы с или з в других позициях определяется произношением, ср.: дисквалификация, дискомфорт, диспропорция, дисгармония, дисбаланс (с перед несонорными), но дислексия, дизъюнкция (написание соответствует произношению).
Врожденная грамотность - миф, однако разные языковые (как математические и иные) способности людей - реальность. Точно так же реально обратное - дислексия и дисграфия.