1. Большая буква не требуется, следует писать со строчной: собор, академия. 2. Сравнительные формы, оканчивающиеся на -ей, в современном русском языке характерны разговорной речи. Если художественный текст не передает разговорную речь, то их лучше заменить на формы с суффиксом -ее.
На этот счет есть несколько разных правил, пунктуация зависит от функции союза, от того, какие именно слова он соединяет.
Форма сравнительной степени на -ей употребляется в разговорной речи.