Это родительный падеж: боится (кого?) медведя, боится (чего?) грозы.
Возможны варианты пунктуации в зависимости от интонации и смысла. Если значение да и «и к тому же», а слова да и ловок выполняют функцию дополнительного замечания, то нужно поставить запятую. Если же значения присоединения нет, т. е. союз да и употреблен в соединительном значении, запятая не нужна.
В современном русском языке в этом слове выделяется только один корень – медведь.
Если они являются не микроописаниями, а названиями пород животных и птиц, то каждое — один член предложения.
Вопрос не вполне понятен. Пожалуйста, поясните, что Вы имеете в виду?
В ударной позиции букве О в русском языке соответствует звук [о] - огубленный гласный непереднего ряда среднего подъема; букве А соответствует звук [а] - гласный нижнего подъема.