Верны оба варианта.
См. также: http://new.gramota.ru/spravka/trudnosti?layout=item&id=36_200&v=full
Правильно: по окончании лечения (т. е. после).
Правильно: о кесаревом сечении.
Эти слова можно написать без кавычек.
В доступных нам печатных источниках топоним Фарасы может оставаться несклоняемым (я из Фарасы). Вместе с тем встречаются и тексты авторов, использующих сочетания, в которых топоним представлен в склоняемом виде: храм в Фарасах, священник из Фарас.
Кавычки не требуются.
См. в «Словаре трудностей».
Кесаревы сечения, кесаревых сечений...
Точка в сокращении мин не ставится.
Так как существительное исход употребляется в данном случае не в абстрактном, а в конкретном значении (в форме множественного числа, может образовывать сочетания с количественными числительными), то предпочтительна форма винительного падежа: ...не ухудшив перинатальные исходы.