Согласно "Русскому орфографическому словарю", коммандос (наименование воинского подразделения в некоторых зарубежных армиях) – форма единственного и множественного числа существительного.
Запятая не требуется.
Правильно: ...что бы мы там ни изобретали...
В предложении трудности не со знаками, а со структурой. Следует перефразировать: Разрушив эти храмы, мы утратим их навсегда; Это храмы, которые навсегда будут утрачены, если мы их разрушим.
Эти слова функционируют в русском языке только как имена собственные (наименования различных организаций, как свидетельствуют поисковые системы).
Не нужна.
Продолжение фразы все объясняет: ...А всяким словом Божиим.
К сожалению, фиксации этого слова в словарях русского языка пока что нет. Есть только слово коалесценция. В Сети более распространен вариант коалесцер.