Такое управление (аллергия к чему-либо) ошибочно. Правильно только: аллергия на что-либо. См.: Лазуткина Е. М. Словарь грамматической сочетаемости слов русского языка. М., 2012.
Запятая после выбери нужна. Она ставится на границе частей сложноподчиненного предложения (между главной и придаточной частью).
В подобных сочетаниях с отвлеченными существительными употребляется родительный падеж. Верно: спросить разрешения. Ср. вариант с конкретным существительным: попросить чашку.
Правильно: встретиться с генерал-майором Виталием Шуликой.
Знаки препинания перед писать не требуются. Но допускается постановка интонационного тире.
Возможны два варианта: «колышущееся» и «колыхающееся».
Да, существует.
Корректно: Пусть судьба на все твои желания в ответ промолвит «Да» или Пусть судьба на все твои желания в ответ промолвит: «Да».
Пунктуация корректна.
Правильно: заведующий лабораторией. Такие слова, как заведующий, управляющий, командующий (т. е. существительные, произошедшие из причастий), управляют творительным падежом.
