Ваш вариант пунктуации корректен.
Да, присоединительные обороты, начинающиеся союзом «в том числе», последовательно обособляются. Подробные рекомендации см. в «Справочнике по пунктуации».
Для обозначения числа используется пара цифр: 01.01.2012.
В обычных текстах: Русская православная церковь. В церковных текстах все слова могут быть написаны с большой буквы.
Если писать цифрами: с 2 по 8 сентября.
Деепричастие от глагола тереться неупотребительно.
Существительное прогноз 'основанное на специальном исследовании предсказание, заключение, суждение о дальнейшем течении, развитии событий, явлений, исходе чего-либо' не употребляется с предлогом по. Ошибочно также употребление с предлогом о (прогноз о чём-либо). Правильно: прогноз чего-либо (прогноз погоды, прогноз хода испытаний) и прогноз относительно чего-либо (прогноз относительно течения болезни). См.: Лазуткина Е. М. Словарь грамматической сочетаемости слов русского языка. М., 2012.
Это слово может употребляться и как существительное мужского рода, и как существительное женского рода.
Есть список рекомендованых словарей, но куцый. Многие нужные словари в нем отсутствуют.
Верно: ранее леченные.