Верно: испекла. Вариант спекла - просторечие.
Мужские фамилии, имеющие основы на согласные и нулевое окончание в именительном падеже (на письме они кончаются согласной буквой, ь или й), кроме фамилий на -ых, -их, склоняются. То есть верно: Кокуса Михаила. Подробности - в "Письмовнике".
Если это сочетание употребляется в значении "что-то крайне необходимо", то оно не обособляется.
На наш взгляд, наиболее корректный вариант: места ожидания в очереди на представление и получение документов.
Возможны оба варианта, в данном случае предпочтительно слитное написание.
Если слово вовремя относится к обоим определениям, то оба они пишутся раздельно: не заполненный и не сданный. Если только ко второму, то корректно: незаполненный и не сданный вовремя...
Предпочтительно склонять: в микрорайоне Южном.
"Читать мораль" в значении "поучать, наставлять" - корректное сочетание. В словарях оно отмечается как разговорное.
Да, нужно склонять обе части: в квартире-пентхаусе.
Названия микрорайонов, оканчивающиеся на -о, склонять не желательно, поскольку при склонении проблематично восстановить исходную форму: в Смакаеве - это Смакаев или Смакаево? Названия, оканчивающиеся на -а, можно и нужно склонять.