Обстоятельственное сочетание в семье потомственных физиков можно считать уточнением обстоятельства в Дубне (уточнение — это переход от более широкого понятия к более узкому); в этом случае логическое ударение будет нести как одно, так и другое обстоятельство. Однако обстоятельство в Дубне само по себе достаточно конкретно, а потому в обязательном уточнении не нуждается. Без запятой логическое ударение будет нести только обстоятельство в семье потомственных физиков.
Корректно: Хочу сказать спасибо.
Эту фамилию нужно склонять как нарицательное существительное мишура. Склоняется и мужская, и женская фамилия.
Ошибок нет.
Буквально: пройти через все испытания, получить большой опыт.
Сочетание корректно, хотя возможен контекст, в котором оно будет восприниматься как избыточное.
Названия этих городов – существительные мужского рода.
Ударение падает на последний слог: пила воду.
Род таких существительных определять не принято.