Корректно: работа на компьютере.
В «Словаре собственных имен русского языка» Ф. Л. Агеенко эстонские фамилии на -а склоняются. См., например, фамилию Кёёрна.
Корректно: верхушка легких немного, на 1-3 сантиметра, выступает за ключицу.
См. в Проверке слова.
Корректно: не брать на себя ответственность за...
Часы-будильник со стр. 2 – не лучший вариант. Возможно так: часы-будильник, изображенные на стр. 2 или часы-будильник (см. стр. 2).
Какого-либо четкого правила не существует; такова литературная норма.
Ответить на вопрос, почему правильно употреблять в каком-либо сочетании тот или иной предлог, зачастую не представляется возможным. Сочетаемость слов в русском языке обусловлена целым рядом факторов; современное состояние языка – результат долгого и не всегда прямолинейного его развития.