Это предложение с однородными сказуемыми (волны шли и качали), поэтому запятая перед и не нужна.
Сочетание глубокие недра не является плеоназмом. Оно употребляется и в художественной, и в научной литературе: Тут бог знает из каких глубоких недр вылезают наружу старые, заржавленные, давно забытые предрассудки (А. Куприн); Их используют для объяснения процессов, происходящих в земной коре и в глубоких недрах земли, а также для изучения минералообразования (Журн. «Наука и жизнь»)
Нет, верно: с 2001 по 2005 год.
Правильно: столица... имела удачное расположение.
Возможны оба варианта. Но более употребительно: прошли годы.
Верно: в ЗАО «Росава» или на предприятии «Росава».
Возможны оба варианта, но более употребительно минерализованная вода.
Правильный вариант: "утвержден бюджет на 2023–2024 годы".
При указании периода времени, охватывающего несколько неразрывных лет, следует использовать форму множественного числа: за период 2020–2025 годов.
Корректно: с 1860-х по 1914 год.
