Предпочтительно раздельное написание.
Корректно: ...на срок, указанный в договоре, но превышающий срок или не превышающий срок...
Верно: Пострадавшего, находящегося без сознания, необходимо уложить на бок. Раздельное написание корректно, если имеется в виду часть тела (ср. уложить на правый / левый бок). В приведенном контексте в сочетании с глаголом уложить предпочтительно именно такое употребление.
Правильно: Иванова Е., ученица муниципального образовательного учреждения «Озёрная СОШ № 9».
Оба варианта верны.
Верно: продлить срок пребывания Иванова в командировке.
Если Вы имеете в виду вторую закрывающую скобку, то в ней нет необходимости, так как текст после скобки не продолжается. Две скобки ставят в структурно сложных текстах, где без второй скобки могут быть неясны границы вставок, например в правилах орфографии.
Содержательной разницы нет. Правильнее говорить: срок действия - с такого-то по такое-то число (до такого-то).
Об этих правилах можно прочитать в «Письмовнике».
