После союза но запятая ставится при наличии паузы и не ставится, если паузы нет. Решение принимает автор текста.
Деепричастный оборот, в начале которого стоят частицы только, лишь, интонационно не отделяется от предшествующей части предложения (при чтении пауза перед ним не делается), но запятая перед ним обычно ставится: Скоординировать свои действия преступники могли, только находясь в СИЗО.
Запятая не нужна.
Если овальные разрастания — другое название узелковых разрастаний, то корректна пунктуация: В области нервных волокон обнаруживаются узелковые, или овальные, разрастания. Если имеется в виду только то, что узелковые разрастания имеют овальную форму, то лучше написать: ...обнаруживаются овальные узелковые разрастания.
Запятая ставится.
Запятая ставится.
Запятые в этом предложении не нужны.
Запятая перед да не нужна.
Запятая не нужна.
Запятая нужна: в уходящем, 2014 году...
