Правильно: состоит на вооружении.

По общему правилу здесь ставится запятая: она отделяет придаточную часть от главной в сложноподчиненном предложении. Тире в таких случаях (когда придаточная часть предшествует главной) возможно, но ставится гораздо реже — при необходимости подчеркнуть интонационное и смысловое членение высказывания.

Запятая ставится между двумя простыми предложениями в составе сложносочиненного.

Предпочтителен предлог с: сталкиваемся с ртутью.

Мы уже отвечали на этот вопрос. См. ответ № 220348.

Кодификация этого заимствованного слова менялась. Прежде «Русским орфографическим словарем» РАН было установлено написание сэнсэй (и мы отвечали, что следует писать так, ориентируясь на словарную рекомендацию). Но теперь академический орфографический словарь фиксирует написание сенсей, его и следует выбрать. Колебания в написании недавно вошедших в русский язык слов — совершенно нормальный и естественный процесс.

У этих двух оборотов, вопреки любому мнению о возможных смысловых различиях, весьма продолжительная история речевого сосуществования.

О первом примере см. ответ на вопрос № 327147. При глаголе назвать в значении «присвоить имя» существительное может стоять как в именительном, так и в творительном падеже (см. соответствующие примеры в словарных статьях этого глагола).

Вообще говоря, из определений, которые даются прямому и косвенному дополнению, следует, что эти характеристики применяются к дополнениям, выраженным именными частями речи, поэтому дополнение, выраженное инфинитивом, не может быть охарактеризовано в этом аспекте. В то же время отметим, что в академической «Грамматике русского языка» (М., 1960. Т. 2. Ч. 1. С. 565) параграф «Дополнения, выраженные инфинитивом» включен в подраздел «Косвенное дополнение». В пособии Е. И. Литневской, размещенном на нашем портале, дополнение, которое выражено инфинитивом, также отнесено к косвенным.

Да, нужно закрыть пояснительный оборот с союзом в том числе.