В этом случае обособление обстоятельства времени по будням факультативно (см. параграф 74 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина).
Лучше выбрать первый вариант: Остальных подростков зовут Лиам и Чарльз по прозвищу Пончик.
Запятая перед по прозвищу ставится или нет в зависимости от интонации. Дело в том, что приложение, присоединяемое словами по прозвищу, может выделяться запятыми, если нужно передать соответствующую интонацию. Если интонации обособления нет, запятая не нужна.
См. «Словарь трудностей».
Лучше: еще по одной.
Правильно: по пятьсот километров.
Верно: скучать по лицею.
Правильно: по предъявлении документа.
Правильно: с бору по сосенке.
Правильно: по итогам состоявшейся встречи.
