Верно: за более чем полвека.
Эту фамилию следует склонять.
Правильно: со Светланой Кузнецовой.
Верно: врио.
Счет-фактура – существительное мужского рода: входящий счет-фактура.
Нужно согласовать определение с определяемыми словами: контроль за организациями и подразделениями (какими?), занятыми в реализации проекта.
Тире возможно. Подробнее о постановке тире в подобных предложениях — в полном академическом справочнике «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина (М., 2006 и след.), см. § 18.
Корректно раздельное написание: не помеченные на удаление объекты.
Формальных ограничений на склонение нет, ср. Минздрав — в Минздраве, Минюст — к Минюсту. В неофициальной речи могут склоняться и названия Минрегион, Минкрым, Минкавказ, однако в официальной речи нужно использовать не сокращенные, а полные названия этих министерств.
Нужно написать слитно.
