Верно: ...в размере девяноста одного миллиона рублей РФ.
Верен первый вариант. См. раздел Согласование сказуемого с числительными в Письмовнике.
После сокращения млн точка не ставится.
Точка после этих сокращений не ставится.
Верно: арестован 21 миллион франков.
Второй вариант лучше.
Вопрос классификации может решаться в разных научных источниках по-разному. С точки зрения академической грамматики, например, к 2-му склонению отнотся существительные типа мама, юноша и т. п. Школьная классификация предполагает отнесение существительных типа следствие к 2-му склонению, наряду с существительными типа стол, конь, гений, окно, поле. См. : https://gramota.ru/biblioteka/spravochniki/russkij-yazyk-kratkij-teoreticheskij-kurs-dlya-shkolnikov/sklonenie-sushchestvitelnykh