Как нетрудно убедиться, различия могут быть связаны только с употреблением разных предложно-падежных форм. При использовании винительного с предлогом в речь идет скорее о ситуации, когда окно открыто (ветер влетает в окно; когда оно закрыто, это не предполагается). При использовании родительного с предлогом из речь идет скорее о ситуации, когда окно закрыто, но неплотно и сквозь щели интенсивно проникает холодный воздух. В этом случае возможно и От окна дуло.
См. словарную фиксацию.
Корректно: ...становилось ватным и чужим.
В обоих предложениях не требуется постановка тире.
В указанном месте необходим знак препинания: он разделяет части сложноподчиненного предложения. По общему правилу нужна запятая. Поскольку в данном случае придаточная изъяснительная часть предшествует главной, вместо запятой можно поставить тире.
