Орфографически корректно: врач – стоматолог-ортопед. В сочетаниях с приложениями, если одна из частей в свою очередь является сочетанием с приложением и содержит дефис, должен употребляться знак тире. См.: Правила русской орфографии и пунктуации. Полный академический справочник. М., 2006, 2013. Параграф 154, пункт 2.
Дело в том, что в предложении "Он не врач" отрицательная частица относится не к существительному врач, а к отсутствующему глаголу-связке "быть" в составе именного сказуемого; он не (есть) врач, ср.: он не был врачом.
Оба варианта возможны.
Каков вопрос?
Нет, запятые не нужны.
Знаки двоеточие и тире не нужны: Предложения вашей организации по теме «…» рассмотрены.
Не пишется раздельно: не являющиеся вашей основной деятельностью.
Знаки препинания в предложении расставлены правильно.
