Правильно: обе стороны, с обеих сторон.
Здесь все зависит от того, с какой глагольной формой связано обстоятельственное сочетание в целях оптимизации кадровой структуры Департамента. Если оно связано с деепричастием руководствуясь, то запятая нужна, чтобы закрыть причастный оборот. Если с причастием утвержденного — запятая не нужна, поскольку в этом случае сочетание входит в причастный оборот. Если же указанное сочетание связано с глаголом внести (изменения), то нужно изменить порядок слов: В целях оптимизации кадровой структуры Департамента, руководствуясь пунктом 25 Положения о Департаменте, утвержденного постановлением Администрации от 08.12.2024 № 25, внести изменения...
Постановка запятых не требуется.
Предпочтительнее форма множественного числа.
Правильно: согласно приказу.
Лучше поставить запятую перед сообщаем, так как оборот с предлогом в связи достаточно распространенный. Но вариант без запятой тоже не будет ошибочным.
Правильно: вернуть 55 552 (пятьдесят пять тысяч пятьсот пятьдесят два) рубля.
Произносится: двадцать пятого ноября две тысячи восьмого года.
Правильно: 3 000, 15 000. Числа делят пробелами на группы (по три цифры справа налево).
Постановка двоеточия корректна.