К сожалению, в доступных нам словарях информации на этот счет нет.
Может быть, просто мальков (без "рыбы"). Если имеются в виду разные породы рыб, то лучше во мн. ч.
Запятые не требуются. Можно поставить тире после рыба.
Частица ну не отделяется запятой: Ну да ведь ты не знал, что рыба большая.
Есть закономерность. Так называемый партицив (родительный падеж в конструкциях, приведенных Вами) используется для указания "части целого": можно воды (часть, немного, стакан...), рыбы (не всю), икры (сколько-то). Если целое на части не делится, то используется только винительный падеж в конструкции со словом можно.
В доступных нам словарях это слово не отмечено.
Ловить рыбу в мутной воде – неодобр. извлекать выгоду для себя, пользуясь неясностью обстановки, чьими-либо затруднениями.
Некорректно. Верно: филе рыбы.