Первый вариант предпочтителен.
Корректно: в рейтинг вошла 51 компания из региона.
Правильный второй вариант. Правописание слов можно проверять в окне «Искать на Грамоте».
Написание зависит от того, относится ли отрицание не ко всему сочетанию (тогда надо писать раздельно) или только к прилагательному (тогда слитное написание корректно). Ср.: это не нефтегазовый регион, а природный заповедник и правила одинаковы для всех регионов – нефтегазовых и ненефтегазовых.
Корректно: Азиатско-Тихоокеанский регион, Азиатско-Тихоокеанский парламентский форум, Азиатско-Тихоокеанское экономическое сотрудничество.
Корректно со строчной оба слова.
Верно: 77% франшиз приходится на регионы.
Оба названия пишутся с большой буквы: Центральный экономический район, Центральный регион.
Корректно с прописной: Московский регион.