Это вопрос делопроизводства, он не связан с русским языком. Тем не менее постараемся ответить. Типовая инструкция по делопроизводству в федеральных органах исполнительной власти указывает: оттиск печати должен захватывать окончание наименования должности лица, подписавшего документ. Речь идет о печати федерального органа исполнительной власти, но, думаем, это положение применимо ко всем организациям.
Оба варианта можно использовать в перечисленных Вами контекстах. Варианты равноправны.
Предложение построено неудачно, его нужно переформулировать.
Корректно: для налогоплательщиков – организаций, а также физических лиц – устанавливается...
Возможны оба варианта, но лучше: отзыв о выполненной работе, так как сочетание проделанная работа не всегда предполагает результат.
Сказуемое согласовано верно.
Вы имеете в виду форму, в которой должно стоять сказуемое при таком подлежащем? Сказуемое в таких случаях согласуется с родовым словом (предприятие). Например, верно: Государственное унитарное предприятие "Научно-исследовательский и проектный институт Генерального плана города Москвы" провело конференцию...
Да, запятая нужна (обособляется определительный оборот воплощенные в новом качестве).
Запятая не нужна.