Верно: 5 мл содержит.
Верно: в размере 5,0 должностного оклада.
Кавычки уместны, особенно если указываются версии программы, например: «1С:Бухгалтерия 8», конфигурация «1С:Бухгалтерия УСН 7.7» и т. д. Кавычки подскажут читателю, что вся эта последовательность цифр, букв и слов составляет одно название. Если просто употребляется обозначение 1C, то в принципе можно обойтись без кавычек: программа 1С. Но если название 1С используется в тексте наряду с более сложными обозначениями, то для единообразия корректно и его заключать в кавычки.
Оба варианта возможны.
Верно: семь с половиной очков, недель; 7,5 (семь и пять десятых) очка, недели.
Нет, наращение в этом случае не требуется.
Правильно: согласно ГОСТу. Но (с номером): согласно ГОСТ Р 7.0.12-2011
Запятые не нужны. Имя ученика не несет на себе пояснительного оттенка значения, при котором оно должно обособляться. Ср. с примером из свода «Правила русской орфографии и пунктуации. Полный академический справочник» (под ред. В. В. Лопатина. М., 2006): Четвертой бригады дежурный бригадир Зырянский дежурство по колонне принял.
Слово вообще может быть вводным, если употребляется в значении «вообще говоря». Подробнее см. в «Справочнике по пунктуации».
Обучающиеся в 5 классе, но ученики 5 класса.