Верно: К тому же в них содержится много витаминов и клетчатка, улучшающая пищеварение.
Предложение составлено верно.
Слово смысл достаточно часто употребляется во множественном числе. Без контекста не вполне ясно, что имеется в виду в Вашем примере, но такая фраза возможна.
Да, запятую надо поставить.
Тире не требуется.
Глаголы типа использовать, которые могут употребляться как глаголы совершенного вида и несовершенного вида, называются двувидовыми. Их довольно много, хотя точные цифры назвать затруднительно.
Вот еще некоторые примеры: обещать, исследовать, наследовать, использовать, исповедовать, напутствовать, содействовать, атаковать, командировать, госпитализировать, организовать, казнить, ранить, молвить, велеть.
Да, запятая ставится.
Такое употребление некорректно. Возможна замена на "сферы ответственности".
Лучше все-таки: истории болезни.