Верно: с более чем ста институтами.
Русское словесное ударение
Запятые не нужны. Союз и соединяет однородные сказуемые.
Это наречия или предлоги (детально - в соответствующих словарных статьях).
Здесь необходимо поставить тире с пробелами: ...на глубине ста ― ста двадцати метров.
Верно: ...из ста сорока одного магазина (так как числительное кончается на один). Но предложение, действительно, небезупречное, и его лучше перестроить, если есть такая возможность.
Это ошибка. См. также http://new.gramota.ru//spravka/letters/61-rubric-92
Да, верно: стакан со ста миллилитрами воды.
Верно: с вдетыми нитками.
Предлог со употребляется: 1) перед словами, начинающимися с сочетаний [с, з, ш, ж + согласный] или с согласного [щ]: со ста, со славой, со звездой, со шкафа, со жгутом, со щами; 2) перед формами родительного и творительного падежа слов лев, лёд, лён, лоб, мох, ров, рот: схватка со львом, виски со льдом; 3) со словами мной, мною; 4) перед формами слов вошь, весь, всякий, всяческий, вторник, второе, второй, многие, многое: со всяким встречным, со многими людьми. Предлог со употребляется в устойчивых сочетаниях: со вкусом (делать что-либо); со вниманием (в знач. 'внимательно': выслушать со вниманием); со временем (в знач. 'в будущем': со временем все наладится); со двора (уйти); со дня на день (в знач. 'скоро'), со дня (в знач. начальной точки отсчета времени: со дня свадьбы прошло два месяца), со дна (достать). С переносом ударения предлог со употребляется в сочетаниях: со свету (сжить), со смеху (помереть), со ста (сдача). Перед формами слова вчерашний могут употребляться оба предлога – с и со: с вчерашнего дня и со вчерашнего дня.
В таком случае лучше написать словами (как Вы и сделали).
По-прежнему правильно: более двухсот (трехсот, четырехсот...) рублей. Вариант более двухста (трехста, четырехста...) – очень распространенная ошибка. Говорящих сбивает нормативное сочетание более ста рублей.
