Сам по себе корень употребляться не может; можно говорить о допустимости / недопустимости употребления слова с этим корнем. Глагол ложиться (форма повелительного наклонения этого глагола – ложись) входит в состав современного русского литературного языка, а вот глагол ложить – нет, т. е. употребление слова ложить в речи грамотного человека недопустимо.
Да, написание в кавычках со строчной корректно во всех случаях.
Верно: Стала относиться к себе по-другому.
Запятая не нужна: относиться к вещи как к своей собственной. Запятая не ставится, т. к. сказуемое не имеет смысла без оборота с как (не имеет смысла сочетание относиться к вещи).
Это глагольные словосочетания.
Можно, хотя это выражение и не является устойчивым.
Такая формулировка возможна. Может быть, лучше: Куда ставить (класть) папки?
