Корректно: управляющий централизованной религиозной организацией "Тобольско-Тюменская Епархия Русской православной церкви".
Верно: Организация ежегодных инвентаризаций и руководство их проведением.
Выбор сочетания зависит от контекста.
Запятая перед определительным оборотом после определяемого существительного нужна: Организация, выставившая счет.
Кавычки будут уместны в этом случае.
Можно употребить оба слова – и наименование, и название. Они синонимичны и различаются стилистически: название – нейтральное, наименование – характерно для официально-деловой речи. Обратите внимание: аббревиатура вуз пишется строчными.
Если человек или компания организовывали конференции, то верно: За организацию научно-практических конференций.
Пожалуйста, сформулируйте Ваш вопрос по русскому языку.