Каков вопрос?
Тире в данном случае совершенно не обязательно, но возможно как интонационный знак. Другими словами, ни наличие тире, ни его отстутствие ошибкой не будет.
Этот оборот обычно не обособляется. Также см. в "Справочнике по пунктуации".
Можно написать первый квартал и 1-й квартал, но обычно квартал обозначается римской цифрой: I квартал.
Запятые нужны.
В справочнике Д. Э. Розенталя сказано следующее. Обычно обособляются несогласованные определения, дополняющие или уточняющие представление о лице либо предмете, который сам по себе (без определения) достаточно конкретен, уже известен. В этой роли выступают имена собственные (они выделяют лицо-предмет из ряда подобных), названия лиц по степени родства.
1. Правильно: с декабря 2009-го по декабрь 2012 года.
2. К строительству второй очереди Транснефть приступила.
Если трест является филиалом АО «РЖДстрой», то грамматически корректно: управляющий строительно-монтажным трестом № 11 – филиалом АО «РЖДстрой». Но нужно учитывать, что в официальном названии должности должно быть точно воспроизведено официальное название организации.