Правильно: период.
Буква ю используется в русском письме в двух функциях: для обозначения гласного звука у с одновременным указанием на мягкость предшествующего парного согласного (люблю) и для передачи сочетания согласного звука j с последующим гласным у (юбка).
Названную запятую ставить не нужно.
Предпочтительно склонение без выпадения гласной: Баёка.
Да, название следует заключить в кавычки.
В подобных случаях возможны разные способы оформления. Выбор зависит от типа издания. В научной и учебной литературе более употребительны такие приемы: звук [а], буква е, слово дом. В публицистическом тексте возможно выделение кавычками.
Запятая в сочетании после мягкого перед твердым не ставится. Если речь идет о запятой после слова звук, то нужен более широкий контекст, чтобы решить, следует ли ее поставить.
Возможно и слитное, и раздельное написание.
См. раздел «Словари».