Возможны оба варианта.
Правильно слитное написание: неознакомление. Не с существительным пишется слитно, если в предложении нет противопоставления.
Да, в данном контексте выражение "красные флаги" нужно заключать в кавычки, так как это выражение используется в переносном смысле.
В данном случае непонятно, как можно показать размышления. Поэтому правильнее будет: Итоги многодневных размышлений, которые никому не показал...
Кавычки не требуются. Но, если нужно подчеркнуть необычность этого выражения, можно заключить в кавычки все три слова: «мужчины из стали».
Если речь идёт о самостоятельном имени Ата, то оно склоняется как существительное первого склонения: Аты, Ате, Ату, Атой, об Ате.
Если же это компонент имени -ата, тогда он не изменяется: легенда о Коркыт-ата.
Вне контекста эту фразу можно истолковать двояко.
1. Стал пользоваться советами (кого?) живших в монастыре (кого именно?) опытных старцев. В этом случае опытные старцы – приложение, которое лучше отделить знаком тире: Стал пользоваться советами живших в монастыре – опытных старцев.
2. Стал пользоваться советами (кого?) опытных старцев (каких?) живших в монастыре. Старцев – дополнение, живших в монастыре – определение. Тогда запятая не нужна: Стал пользоваться советами живших в монастыре опытных старцев.
Запятая после ходила нужна.