Вы правы, наращение не пишется.
Корректно: Среди 75 исследованных изолятов 8 % и 25,3 % штаммов принадлежали к типу К1 и К2 соответственно. Но: 20—40 % штаммов.
Это вопрос не к лингвистам, а к специалистам по верстке, дизайну, техническому оформлению текста. См., например, рекомендации Артемия Лебедева.
Слово миллионов (или другое обозначение числа) здесь необходимо во избежание двусмысленности, указанной Вами.
Такое согласование (или рассогласование) не является ошибочным для разговорной речи.
В некоторых контекстах такое сочетание может использоваться, но не всегда.
Тире обычно не ставится, когда подлежащее выражено личным местоимением, а сказуемое – существительным. Но тире возможно как интонационный знак. Окончательное решение – за автором текста.
Верно: Иван — молодой, подающий большие надежды ученый.
Такое употребление не соответствует нормам литературного языка.
