Верно: органы грудной и брюшной полости.
Должно бы, конечно, ставиться на первый слог, однако такое прилагательное нормативными словарями современного русского языка не зафиксировано.
Корректно: органы управления рыбохозяйственной деятельностью.
Согласование верное: форма мн. ч. глагола корректна.
Оба варианта употребительны.