Оба варианта верны. Об угле и углях см. в электронных словарях на нашем портале:
Орфографический словарь
уголь 2, угля, мн. угли, углей и уголья, угольев (кусок обгоревшего дерева)
Словарь трудностей
Знаки препинания расставлены верно.
Буквенное наращение не требуется писать после цифр, обозначающих количественные числительные.
Корректно: ...более чем 2,7 тысячи работников угольной компании.