"Оканчивается на" - речь о последних буквах (звуках) в слове. "Имеет окончание" - речь о значимой части слова, морфеме. Окончание выражает грамматическое значение падежа (для существительных) и лица (для глаголов), а также рода, числа.
Определения мрачный и пустынный в общем случае характеризуют берег с разных сторон: мрачный говорит о производимом им гнетущем впечатлении, пустынный — об отсутствии на нём людей, животных, растений. Следовательно, запятая между ними не нужна. Другое дело, что второй из этих признаков тоже может производить гнетущее впечатление. Если требуется подчеркнуть это в художественном тексте, то определения можно счесть однородными и поставить между ними запятую.