Корректно: Заведующий отделом кандидат философских наук, заслуженный работник республики...
Кандидат – многозначное слово. Одно из значений Вы привели. В сочетании кандидат каких-либо наук слово кандидат употребляется во втором значении – 'младшая ученая степень, а также лицо, имеющее эту степень'.
Корректно: Если они не соблюдены или кандидат ушел из компании в период испытательного срока, кадровое агентство ищет замену бесплатно.