Оба способа произношения отчества (полный и стяженный) соответствуют литературной норме. А писать нужно полностью: Николаевна.
Верно: монастырь Святого Николая.
Корректно: музей Николая Островского, т. к. это не официальное название организации: слово музей не начинает здесь имя собственное, а обозначает тип учреждения.
Русские фамилии на -ин (-ын) и -ов (-ев) имеют в творительном падеже окончание -ым. Правильно: Лениным, Сталиным, Пришвиным, Бородиным, Ельциным и т. п. Этому же правилу будет подчиняться и фамилия Чаплин, если это будет русская фамилия, например: Николай Чаплин – Николаем Чаплиным.
В иностранных же фамилиях на -ин и -ов в творительном падеже пишется окончание -ом. Правильно: Чарли Чаплином, также: Гершвином, Дарвином и т. п.
Мужская фамилия Глух склоняется: Сегодня с нами нет Николая Петровича Глуха.
Правильно без запятой.
В договоре верно: действующего.