Оба варианта употребительны.
Это причастие. Не забудьте поставить запятую (обособить причастный оборот).
Обычно в подобных случаях написание зависит от размера подразделения и уровня в иерархии. Названия наиболее крупных подразделений в организациях с большим количеством подразделений, секторов, отделов, подотделов и проч. пишут с прописной буквы.
Корректно: Правопреемник или иное предусмотренное федеральным законом лицо представляет в лицензирующий орган...
Корректно: Орган местного самоуправления обязали компенсировать моральный ущерб, причиненный укусом бездомной собаки.