Верно: врио командира Иванову И. И. Падеж слова командир определяется при расшифровке: временно исполняющему обязанности (кого?) командира Иванову И. И.
Запятая факультативна (ставится при интонационно-логической паузе, указывающей на уточнение).
Начальник караула — это должность, а должность и звание являются неоднородными приложениями и не разделяются запятой: Операцией командовал начальник караула лейтенант внутренней службы Иванов Иван Иванович.
Принято ставить запятую после слов с уважением.
Если это мужское имя, склоняется последняя часть: Чун Ён Бина.
В составных именах и фамилиях китайских, корейских, вьетнамских склоняется последняя часть (если она оканчивается на согласный звук).
См. в «Письмовнике».
Лучше перефразировать: 50-летняя профессор Иванова из России.
Корректно согласование в форме мужского рода.