Оба варианта корректны.
В указанном отрывке не нужны запятые и иные знаки препинания.
Слитное написание правильно.
Запятая не нужна. Оборот с предлогом согласно образует смысловой центр предложения.
В этом сложноподчиненном предложении запятая между частями не ставится, потому что перед подчинительным союзом когда стоит союз (частица) и. См. пункт а) параграфа 115 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
Сочетание всё что хочешь употреблено в значении ‘что угодно’, поэтому никакие другие запятые в предложении не нужны.
Именительный падеж предпочтителен, он удобнее для читателя. Можно поправить: ...в ней различаются пять стадий...
Запятая перед пока нужна. Обратите внимание, что нет оснований писать слова внутри предложения с большой буквы.
