В конце предложения не нужно ставить две точки.
Запятая имеет право на существование.
Пробелы ставятся и в научном тексте, и в ненаучном. Правильно: В. П. Иванов.
В этом случае возможны варианты переноса.
Запятую ставить не нужно.
Запятые не нужны, если оборот с союзом "как" не имеет сравнительного значения (здесь - скорее "защитился по специальности литературоведа").
Правильно: один из крупнейших торгово-сервисных модулей.
После "уважаемый" запятая не нужна. А вот после обращения (здесь - после отчества) нужно поставить знак препинания.
Эти обороты следует выделить как вводные, так как они указывают на то, что дальнейшее сообщение отражает точку зрения говорящего.
Верно: вопреки ему.
См.: mestoimenie">http://gramota.ru/spravka/letters/?rub=nmestoimenie