Возможны оба варианта, чаще употребляется первый.
Правильно слитное написание: моторвагонный подвижной состав.
Следует писать с маленькой буквы.
В значении "состоящий из баржи и буксира" - барже-буксирный.
Правильно: подвижной состав.
Ход рассуждения следующий.
Заменим местоимение существительным, вместо которого оно употреблено:
Не все растения прижились.
Ясно, что вместо (не) все растения возможны варианты многие растения, некоторые растения, сильные растения, слабые растения и т. д. Очевидно, что подлежащим является только существительное, а местоимение служит определением к нему. Определение является одним из второстепенных членов, но может играть решающую роль в формировании общего смысла предложения — как и другие второстепенные члены; однако это еще не основание для того, чтобы включать их в один из главных членов.
То же касается и исходного варианта предложения: подлежащее — они.
При разборе слова по составу выделяют основу (т.е. комлекс словообразовательных морфем).
Сформулируйте, пожалуйста, конкретный вопрос.
Интересный вопрос. Передадим его профессору В. В. Лопатину.
Запятая не требуется.