Необходимо отделить от определяемого слова причастный оборот предоставленную руководителем.
Запятую ставить не нужно.
Возможный вариант: Имущество, которым наделена организация...
Если организация получила имущество на правах собственности, то можно написать: Имущество, переданное в собственность...
Кавычки не нужны: Русское географическое общество.
Тире между подлежащим организация и сказуемым важная составляющая нужно.
Запятая перед как не требуется.
Верно: три автономные некоммерческие организации.
Да, запятая нужна: по информации (кого, чего, чьей) — вводное сочетание.
В фамилиях (вне зависимости от должности ее носителя) рекомендуется писать букву ё, если в паспорте фамилия написана с ё.
Перед открывающими кавычками запятая не опускается. Если она нужна по условиям контекста, ее сохраняют: Центр помощи женщинам, оказавшимся в кризисной ситуации, «Доверие».