Корректно: На вопрос "почему?" отвечают...

Корректно: Окончил обучение по направлению "Государственное муниципальное управление" в 2014 году. 

Запятая не нужна, покольку части сложносочиненного предложения имеют общий второстепенный член (ранее). 

Правильно раздельное написание: совершенно никем не изученный феномен.

Предложение построено правильно. Однако более привычна более простая формулировка: Нам одобрили создание читательского клуба в библиотеке имени В. В. Маяковского. 

Ошибок нет.

Слово задублирование не является общеупотребимым, поэтому предлагаем заменить его: Необходимо исключить дублирование информации.

Правильно: два или более органа. Например: Система — это два или более связанных между собой органа со сходными функциями.

Это сложноподчиненное предложение с изъяснительным придаточным вопросительной разновидности. Всё дело именно в последнем: изъяснительные придаточные вопросительной разновидности присоединяются к главной части посредством как раз того слова, которое делает их вопросительными: Где твой дневник? — Мама спросила, где мой дневник. Вопросительное местоимение при этом превращается в относительное, то есть в союзное слово.

Но вопросительность в случае так называемого общего вопроса может создаваться не вопросительным местоимением, а частицей: Не сходить ли мне на работу? — Я задумался, не сходить ли мне на работу. Частица берет на себя функцию средства связи, хотя, конечно, ни в союз, ни в союзное слово она не превращается.

А в случае альтернативного вопроса вопросительность создается той же частицей, но «спрятавшейся» в разделительном союзе или: Сходить мне на работу или остаться дома? — Я размышлял, сходить мне на работу или остаться дома. Таким образом, как это ни парадоксально, в СПП с изъяснительным придаточным, которое восходит к альтернативному вопросу, роль средства связи берет на себя сочинительный (!) союз или.