Пробел не ставится, а вот точка ставится после каждой цифры. Правильно так:
1.
1.1.
1.1.1.
1.1.2.
1.2.
2.
Если слово включительно отсутствует, то сочетание до 1-го числа может быть истолковано двояко (1-е число включается во временной интервал / 1-е число не включается в интервал).
Существительным управляет дробная часть: 1,6 тонны (шесть десятых тонны).
Правильно: согласно разделу и приложению. Если слово Договор с большой буквы (как условное обозначение), то слова "указанного выше" не нужны.
Выбор формы единственного или множественного числа существительного зависит от того, какое количество задолженностей описывается: если у каждой компании по одной задолженности (или она для них общая), то верен первый вариант; при наличии нескольких задолженностей выбрать нужно второй вариант.
Да, двоеточие как знак отношения отделяется от чисел пробелами.
Если номер пункта стоит в середине предложения, точка после него не нужна: В пунктах 1.1.1, 1.1.2 настоящего раздела. В пункте 1.1.1 «Выдача средств...».
Есть, Вы написали правильно.